该实验室是与吉林大学生命科学学院于1998年合作成立的国内第一个专门从事古DNA研究的基础型实验室,主要以古DNA分析方法,深入开展中国古代居民的遗传结构分系,建立古DNA数据库,揭示群体历史遗传结构变化规律,从分子水平上揭示古代种族的形成、分化以及迁徙活动。与此同时,还开展古动物和植物的古DNA分析研究工作,揭示家养动植物的起源与演化过程,探讨其与农业社会发展的关系。实验室现占地面积400米,拥有超净工作台,冷冻研磨机,DNA凝胶成像仪,梯度PCR仪,ABI 310 DNA全自动测序仪,紫外分光光度计,高压液相色谱,多种容量和多种速度离心机等价值350万元的仪器设备。